Lehrveranstaltungen von Prof. Sven Rahmann, Bioinformatik, TU Dortmund
Prof. Rahmann hat zum 01.06.2011 den neu eingerichteten Lehrstuhl für Genominformatik an der Medizinischen Fakultät der Universität Duisburg-Essen übernommen, bietet aber weiterhin UAMR-weit Vorlesungen in der Informatik der TU Dortmund an.Allgemeines
- Lehrmaterial (Skripte, etc.)
- Wichtige Hinweise zu allen Lehrveranstaltungen, Prüfungen, etc.!
- Abschlussarbeiten (Bachelor, Diplom, Master)
Aktuell
Sommersemester 2013
- Algorithmische Bioinformatik (2V+2Ü), Vertiefungsmodul INF-MA-606 bzw. Diplom-Spezialvorlesung
- PG 572 "IMobSPi - Ressourcenbeschränkte Analyse von Ionenmobilitätsspektren mit dem Raspberry Pi", Projektgruppe Phase I (8 Pr; 10 LP), wird im WS 2013/14 fortgesetzt.
- Aktuelle Themen der Bioinformatik (Seminar, 2S; 4 LP)
- Betreuung von Abschlussarbeiten (Bachelor-, Master-, Diplom-, sowie Doktorarbeiten), inkl. DDH-Seminar (1+2 SWS)
Frühere Veranstaltungen (UAMR)
Diese Veranstaltungen habe ich als Mitglied der Medizinischen Fakultät der Universität Duisburg-Essen an der Fakultät für Informatik der TU Dortmund gehalten. Möglich ist dies durch die Universitätsallianz Metropole Ruhr (UAMR). Die Veranstaltungen stehen (in Absprache mit den zuständigen Prüfungsausschüssen) allen Informatikstudierenden der UAMR offen.
Wintersemester 2012/13
- Projektgruppe 567 "Computational Epigenomics", Phase II (8 Pr; 10 LP).
- Proseminar "Datenstrukturen, Algorithmen und Programmierung mit Python (DAPy)" (3 PS; 4 LP)
- Bachelor-Wahlmodul Algorithmen auf Sequenzen (2V+1Ü; 4 LP), für Diplomstudierende auch als 3V+1Ü (6 LP, SpG 4/6/7), gehalten von Marcel Martin
- Betreuung von Abschlussarbeiten (Bachelor-, Master-, Diplom-, sowie Doktorarbeiten), inkl. DDH-Seminar (1+2 SWS)
Sommersemester 2012
- Projektgruppe 567 "Computational Epigenomics", Phase I (8 Pr; 10 LP), wird im WS 2012/13 fortgesetzt.
- Proseminar "Datenstrukturen, Algorithmen und Programmierung mit Python (DAPy)" (3 PS; 4 LP)
- Betreuung von Abschlussarbeiten (Bachelor-, Master-, Diplom-, sowie Doktorarbeiten), inkl. DDH-Seminar (1+2 SWS)
Wintersemester 2011/12
- Master/Diplom-Spezialvorlesung Computational Omics (2V+2Ü; 6 LP)
- Betreuung von Abschlussarbeiten (Bachelor-, Master-, Diplom-, sowie Doktorarbeiten), inkl. DDH-Seminar (1+2 SWS)
Sommersemester 2011
- Bachelor-Wahlmodul Algorithmen auf Sequenzen (2V+1Ü; 4 LP), für Diplomstudierende auch als 3V+1Ü (6 LP, SpG 4/6/7)
- Seminar Aktuelle Themen der Bioinformatik (2S; 4 LP)
- Betreuung von Abschlussarbeiten (Bachelor-, Master-, Diplom-, sowie Doktorarbeiten), inkl. DDH-Seminar (1+2 SWS)
Frühere Veranstaltungen (TU Dortmund)
Wintersemester 2010/11
- Master/Diplom-Spezialvorlesung Rekonstruktion biologischer Netzwerke (3V+1Ü; 6 LP)
- Hauptseminar Aktuelle Themen der Bioinformatik (2S; 4 LP)
- Betreuung von Abschlussarbeiten (Bachelor-, Master-, Diplom-, sowie Doktorarbeiten), inkl. DDH-Seminar (1+2 SWS)
Sommersemester 2010
- Bachelor-Wahlmodul Algorithmen auf Sequenzen (2V+1Ü; 4 LP)
- Master/Diplom-Spezialvorlesung Algorithmische Bioinformatik (3V+1Ü; 6 LP)
- Export-Vorlesung Einführung in die Angewandte Bioinformatik (2V+1Ü, für Studierende der Chemischen Biologie; 4 LP)
- Betreuung von Abschlussarbeiten (Bachelor-, Master-, Diplom-, sowie Doktorarbeiten), inkl. DDH-Seminar (2+1 SWS)
- Das Hauptseminar Aktuelle Themen der Bioinformatik findet im Sommersemester NICHT statt!
Prof. Rahnenführer (Fakultät Statistik) bietet aber ein Bioinformatik-Seminar an.
Wintersemester 2009/10
- Spezialvorlesung Algorithmen auf Sequenzen (2V+2Ü oder 3V+1Ü; 6 LP)
- Spezialvorlesung Konvexe Optimierung (2V+2Ü oder 3V+1Ü; 6 LP)
- Fachprojekt Bioinformatik (6 LP)
- Hauptseminar Aktuelle Themen der Bioinformatik (2 S = 4 LP)
- Betreuung von Abschlussarbeiten (Bachelor-, Master-, Diplom-, sowie Doktorarbeiten), inkl. DDH-Seminar
Sommersemester 2009
- Spezialvorlesung Rekonstruktion biologischer Netzwerke (2V+2Ü oder 3V+1Ü; 6 LP)
- Proseminar Algorithmen mit Python (2 PS / 3 PS inkl. Präsentationskurs; 4 LP / 6 LP)
- Hauptseminar Aktuelle Themen der Bioinformatik (2 S = 4 LP)
- Export-Vorlesung Einführung in die Angewandte Bioinformatik (2V+1Ü, für Studierende der Chemischen Biologie; 4 LP)
- Betreuung von Abschlussarbeiten (Bachelor-, Master-, Diplom-, sowie Doktorarbeiten), inkl. DDH-Seminar
Wintersemester 2008/09
- Spezialvorlesung Algorithmische Bioinformatik (2V+2Ü oder 3V+1Ü; 6 LP)
- Proseminar Grundlegende Algorithmen der Bioinformatik (2 PS = 4 LP, oder 3 PS = 6 LP mit Präsentationskurs)
- Hauptseminar Aktuelle Themen der Bioinformatik (2 S = 4 LP)
- Betreuung von Abschlussarbeiten (Bachelor-, Master-, Diplom-, sowie Doktorarbeiten), inkl. DDH-Seminar
Sommersemester 2008
- Spezialvorlesung Algorithmen auf Sequenzen (2V+2Ü oder 3V+1Ü; 6 LP)
- Proseminar Elegante Algorithmen (2PS)
- Hauptseminar Aktuelle Themen der Bioinformatik: Effiziente Verarbeitung großer Datenmengen (2S = 4 LP)
- Export-Vorlesung Einführung in die Angewandte Bioinformatik (2V+1Ü, für Studierende der Chemischen Biologie; 4 LP)
- Betreuung von Abschlussarbeiten (Bachelor-, Master-, Diplom-, sowie Doktorarbeiten), inkl. DDH-Seminar
Wintersemester 2007/08
- Forschungsfreisemester
Sommersemester 2007
- Export-Vorlesung (Blockkurs) Einführung in die Angewandte Bioinformatik (2V+1Ü, für Studierende der Chemischen Biologie; 4 LP)
Noch Frühere Lehrveranstaltungen (vor TU Dortmund)
> Lehrveranstaltungen in der AG Genominformatik der Universität Bielefeld
Sommersemester 2007 (Bielefeld)
- Bachelor-Vorlesung "Sequenzanalyse II (spezielle Algorithmen)" (2V+2Ü, BiG Bachelor)
- Seminar "Algorithmic Problem Solving Techniques" (2S, BiG Bachelor u.a.)
- Projekt "Klassifikation medizinischer GC/IMS-Daten" (392196, 4Pj, BiG Master, Projekt Bioinformatik, 10LP)
- PhD-Seminar "Convex Optimization Problems" (2S, PhD)
Wintersemester 2006/07 (Bielefeld)
- Bachelor-Vorlesung "Grundlagen der Sequenzanalyse" (2V+2Ü, 3. Semester Bachelor)
- Seminar "Data Mining in Graphen" (2S), mit Tim Nattkemper
- PhD-Seminar "Numerical Solutions of Stochastic Differential Equations" (2S)
Sommersemester 2006 (Bielefeld)
- Seminar "Algorithmic Problem Solving"
- PhD-Seminar "Current Topics in Algorithmic Statistics in Bioinformatics"
- Seminar "Algorithms for Reconstructing Gene Regulatory Networks"
- Vorlesung "Statistical Methods in Computational Biology"
Wintersemester 2005/06 (Bielefeld)
- Bachelor-Vorlesung "Phylogenetik", mit Übungen (C. Bannert)
- Projekt "Optimization of Microarray Design"
- PhD-Seminar "Special Topics in Linear and Quadratic Programming"
Sommersemester 2005 (Bielefeld)
- Seminar "Current topics in algorithmic statistics in bioinformatics" (392140; 2S; 3 LP; B.S./M.S./Dipl./Dr.)
- Seminar "Spielregeln für Beruf und Karriere" (392012; 2S; 0 LP; M.S./Dipl./Dr.)
- Seminar "Algorithmic Problem Solving" (392143; 2S++; 5 LP; M.S./Dipl./Dr.)
Wintersemester 2004/05 (Bielefeld)
- Vorlesung "Algorithmische Stochastik in der Bioinformatik" (2V+2Ü; 7 LP; B.S./M.S./Dipl./Dr.), Übungen: M. Kaltenbach
- Seminar "Simulation und Stochastik regulatorischer Systeme" (2S; 3 LP; B.S./M.S./Dipl./Dr.)
- PhD-Seminar "Selected topics in regression" (Blockveranstaltung 09.-13.08.2004; 1S; Dipl./Dr.)
- Seminar "Emerging Biotechnologies: Bioinformatics of the future" (2S; 3 LP; M.S./Dipl./Dr.)
Sommersemester 2004 (Bielefeld)
- Vorlesung "Statistics, Probability and Algorithms for Bioinformatics" (2V+2Ü)
Wintersemester 2003/04 (FU Berlin)
- Spezialvorlesung "Statistics, Probability and Algorithms for Bioinformatics"
- Seminar "Currents in Computational Molecular Biology" (seminar about RECOMB 2003)
Sommersemester 2003 (FU Berlin)
- Praktikum und Seminar zur Sequenzanalyse
Wintersemester 2002/03 (FU Berlin)
- Übungen zu "Algorithmische Bioinformatik" (Vorlesung von M. Vingron)